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DNA碱基序列确定法 DNA sequencing
2007-07-19
点击: 55 本文共1篇文章
有Maxam-Gilbert
法及
Sanger
法(又称双脱氧法,
Dideoxy
法)。前一方法(
Maxam-Gilbert
′
ssequencing method
)是
1977
年发表的方法,又称化学分析法。即把用限制酶切断所得的
DNA
片段的
5
′末端,再用
32
P
标记〔通过使用(
r32P
)
ATP
和多聚核苷酸激酶〕。然后或将双链分离,或用其它限制酶切断,制出只有双链中的一个链的末端被标记。将这样的
DNA
链,通过用碱基特异的化学分解反应,并部分地分解,例如应用与鸟苷残基特异反应进行部分分解,得到从用
32
P
标识的
5
′末端各鸟苷残基部位分解下来的片段之混合物。关于腺苷、胞苷以及胸苷也可这样得到部分分解产物。将这些部分分解产物并列起来,由聚丙烯酰胺凝胶电泳法根据链长进行分离。电泳后,用放射自显影法将在
5
末端含有
32P
的
DNA
片段,通过梯状带进行测定。因从
5
′末端开始各核苷酸在出现的位置上显出带,所以根据变移率的顺序将带记录,则可了解碱基序列。也有不标记
5
’末端,
而是标记
3
′末端来作此实验的。又
Sanger
法(
Sa-nger
′
s sequencing method
,
dideoxy method
)因为是利用
DNA
聚合酶的修复反应,所以也称为酶法。此法的原理发表于
1975
年,但后来曾作了一些改良,从而才形成现在的方法。首先向单链
DNA
加入作为引物的短的互补链,制成异源双链,加入
DNA
聚合酶(参见科恩伯格酶)和四种脱氧核苷三磷酸,使其从弓吁的
3
′末端开始合成
DNA
,此时加入少量的
DNA
延长抑制剂二脱氧核苷三磷酸时,则在吸入此物质的地方
DNA
链的延长便终止。因为二脱氧核苷三磷酸是无规则地被吸收,所以结果从引物形成各种长短的
DNA
链。将由于个别加入四种二脱氧核苷酸而合成的反应产物,通过与前述
Maxam
-
Gilbert
法同样的凝胶电泳法可分析出碱基序列。用这些方法时,在一个凝胶板上可分析多少碱基序列?这主要依赖于凝胶电泳的分离能力,但在标准条件下可以确定出近
200
个碱基序列。
责任编辑:semirock
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